Ни одна из рек Восточного Тимора не является судоходной. Все непересыхающих реки страны берут начало в южной части Восточного Тимора. Причиной этого является длительный сезон дождей в этой части острова.

Это в частности касается и крупнейших рек северной части острова – г. Луас (самая длинная река страны, длина 80 км), г. Северная Лакло и Сейшал. Главными реками юга является Иребере, Бебе, Дилором, Тафари, Белулик, Тафари, Караулун.

Река Сейшал большое озеро в Восточном Тиморе, Ира Лаларо (также Сура-Бек) в районе Лаут. Оно имеет длину 6,5 километра и ширину 3 км. В горных районах есть много водопадов, самым известным является водопад вблизи поселения Атсабе.